One Biosciences annonce une nouvelle méthode de validation des données pour le profilage tumoral transcriptomique unicellulaire à partir d'échantillons de pathologie clinique

Le flux de travail, de l’échantillon au rapport, génère des profils d’expression de l’ARN unicellulaire à partir de lames de pathologie FFPE de routine provenant de quatre établissements, validé sur 88 spécimens et six types de cancer.

PARIS--(BUSINESS WIRE)--One Biosciences, une société de technologies biologiques pionnière dans le profilage des tumeurs unicellulaires de qualité clinique, annonce aujourd’hui des données établissant que les profils d’expression de l’ARN unicellulaire peuvent être générés à partir des échantillons pathologiques standard fixés au formol et inclus dans la paraffine (FFPE) obtenus dans le cadre des soins de routine contre le cancer à l’aide de la plateforme propriétaire de la société, OneMap™.

L’étude, menée avec des collaborateurs du Centre Léon Bérard, de l’Hôpital Bichat–Claude Bernard, de l’Institut Curie et du Memorial Sloan Kettering Cancer Center, a été publiée en préimpression sur BiorXiv.

« Chaque tumeur est un écosystème unique de nombreux types de cellules différents, certaines cancéreuses, d’autres non. Le profilage unicellulaire nous permet de comprendre ce que sont ces cellules, ce qu’elles font et comment cela peut avoir une incidence sur les résultats du traitement », déclare Helena Yu, MD, oncologue médicale thoracique au Memorial Sloan Kettering Cancer Center. « Jusqu’à présent, ce type d’analyse nécessitait des types d’échantillons et des flux de travail différents de ceux que nous déployions dans les soins cliniques. Cette étude montre que nous pouvons effectuer cette analyse à partir des mêmes échantillons que ceux que nous collectons déjà, ouvrant ainsi la voie à une exploration plus approfondie de la manière dont nous pouvons tirer parti de cette technologie pour orienter le traitement. »

L'étude a inclus plusieurs établissements de plusieurs régions et des types variés d'échantillons et de tumeurs pour refléter la diversité rencontrée dans les soins cliniques du monde réel. Les données comprennent les résultats de 88 expériences à noyau unique couvrant les cancers de la vessie, du sein, du côlon, du poumon, de l'ovaire et du pancréas, y compris 36 biopsies de base. Le test a produit des mesures reproductibles de la composition cellulaire et de l'expression génique résolue par type cellulaire. La reproductibilité technique était élevée (corrélation médiane > 0,92 dans les proportions de type cellulaire sur l'ensemble des tests répétés), et les estimations automatisées de l'infiltration immunitaire correspondaient étroitement aux évaluations des pathologistes des lymphocytes infiltrés par la tumeur. Le flux de travail a été concluant sur des blocs archivistiques jusqu'à environ une décennie et sur des biopsies à très faible intrant, et il a quantifié des cibles de conjugué anticorps-médicament cliniquement pertinentes.

Le test utilise le séquençage de l'ARN à noyau unique pour mesurer l'activité génique à l'intérieur de cellules individuelles présentes dans de fines tranches de tissu préparées pour des analyses pathologiques standard. OneMap™, un moteur logiciel alimenté par l'IA, identifie quelles cellules sont présentes et mesure ce que chaque type fait. OneMap™ produit ensuite un seul rapport normalisé pour chaque échantillon, éliminant le traitement par lots requis par les anciennes méthodes unicellulaires.

« L'analyse unicellulaire est un ajout précieux au profilage moléculaire actuel, révélant des informations importantes sur une tumeur que les tests standard ne peuvent pas montrer. Auparavant, il fallait le mauvais type d'échantillons, trop de tissus et d'analyses qui ne fonctionnaient que par lots importants, ce qui rendait les soins aux patients peu pratiques en monde réel », déclare Vincent Miller, président exécutif de One Biosciences. « Cette étude valide notre approche, qui fonctionne sur des lames de pathologie ordinaires que chaque hôpital produit déjà, n'a besoin que d'une fraction du tissu et renvoie un rapport standardisé pour un patient à la fois, créant une véritable solution, de l'échantillon au rapport, qui peut permettre des essais cliniques plus ciblés afin d'améliorer les soins aux patients. »

Les diagnostics tumoraux standard signalent en moyenne des millions de cellules, obscurcissant potentiellement des sous-populations de cellules qui pourraient entraîner une résistance, y compris les cellules immunitaires. Le profilage unicellulaire analyse les tumeurs une cellule à la fois, fournissant des informations critiques pour les chercheurs et les cliniciens. Les études en cours exploreront si les profils unicellulaires peuvent mieux sélectionner les patients. Dans la phase clinique, les profils unicellulaires offrent un ajout important au profilage en lots standard pour éclairer les décisions de traitement en fonction de la composition tumorale propre au patient.

À propos de One Biosciences
One Biosciences est une société de transcriptomique unicellulaire pionnière dans les solutions de profilage tumoral de qualité clinique. Fondée en 2020 en tant que spin-off de l'Institut Curie, la société a mis au point OneMap™, une plateforme de profilage moléculaire unicellulaire de bout en bout, conçue pour aider les cliniciens à sélectionner des traitements optimaux pour les patients atteints de cancer et soutenir les entreprises pharmaceutiques dans le développement de thérapies de précision et de diagnostics compagnons. One Biosciences est soutenu par des investisseurs et partenaires de premier plan tels que Redmile Group, Blast, Sofinnova Partners, Institut Curie, Gustave Roussy et par le Paris-Saclay Cancer Cluster dans le cadre de son programme BOOST. Pour plus d'informations, visitez : www.onebiosciences.fr.

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