Parse Biosciences y Nomic anuncian un conjunto de datos multimodal de 100 millones de células preparado para IA, destinado a la biología inmunológica

El conjunto de datos de perturbaciones sujeto a licencia incluirá transcriptomas y secretomas proteómicos para comprender la respuesta inmunitaria humana

SEATTLE Y MONTREAL--(BUSINESS WIRE)--Parse Biosciences, el proveedor líder de secuenciación de células individuales escalable y accesible y empresa de QIAGEN, y Nomic Bio, un referente en el perfilado proteómico de alto rendimiento, han anunciado hoy una colaboración para crear Cascade, un conjunto de datos fundamental que abarca 100 millones de células, con el fin de comprender la respuesta inmunitaria humana. La escala y la profundidad de este conjunto de datos proporcionarán a los socios del sector farmacéutico información a nivel celular y proteico sobre la biología inmunitaria, lo que acelerará su capacidad para identificar y validar nuevas dianas terapéuticas.

Cascade ya ha obtenido compromisos de socios fundadores por parte de empresas líderes de los sectores farmacéutico y biotecnológico, entre ellas GSK, Pfizer, Sanofi, Graph Therapeutics y Turbine, lo que pone de relieve la demanda de datos inmunológicos multimodales a gran escala en el ámbito del descubrimiento de fármacos.

Cascade es un conjunto de datos multimodal basado en perturbaciones que registra cómo responden las células inmunitarias a un tratamiento a lo largo de varios puntos temporales; se trata, además, del mayor recurso de este tipo preparado para su uso con inteligencia artificial en el ámbito del modelado inmunológico. Este conjunto de datos integra 100 millones de perfiles de ARN de célula única (scRNA-seq) con más de 11 000 perfiles proteómicos del secretoma, documentando la respuesta de distintos tipos de células inmunitarias ante más de 150 000 condiciones de perturbación, tanto individuales como combinatorias, mediante el uso de citocinas y fármacos. Al combinar lecturas transcriptómicas y proteómicas de las mismas respuestas inmunitarias a lo largo del tiempo, Cascade ofrecerá a los investigadores una perspectiva sin precedentes sobre los mecanismos que impulsan la señalización inmunitaria humana, cubriendo así una carencia fundamental de datos necesaria para el desarrollo de modelos celulares virtuales predictivos.

La generación de datos de ARN-seq a nivel de célula individual se llevará a cabo en el GigaLab de Parse, un laboratorio de servicios de alto rendimiento capaz de analizar miles de millones de células al año. Estos datos se combinarán con datos proteómicos del secretoma generados mediante la plataforma Omini 1000 de Nomic, la cual medirá más de 1000 proteínas secretadas en todas las muestras.

“El modelado mediante IA en el ámbito biológico se ha topado con un cuello de botella en cuanto a los datos. A pesar de su papel fundamental en el descubrimiento de fármacos, existe una cantidad sorprendentemente escasa de datos disponibles que midan la respuesta inmunitaria humana ante perturbaciones clave, como las provocadas por citocinas y otros fármacos. Cascade constituye un paso crucial para desvelar estas interacciones y, como resultado, esperamos mejorar drásticamente la capacidad predictiva de los modelos de IA de nuestros socios“, afirmó Charlie Roco, cofundador y director de tecnología de Parse Biosciences.

“Los modelos de inteligencia artificial sobre biología inmunológica deben captar no solo cómo cambian los estados celulares, sino también las señales proteicas que las células emplean para comunicarse“, afirmó Milad Dagher, cofundador y director ejecutivo de Nomic Bio. “Cascade integra mediciones de proteínas cuantitativas y resueltas en el tiempo con datos a nivel de célula individual a una escala que puede ayudar a los investigadores a modelar cómo se desarrollan las respuestas inmunitarias y a predecir cómo estas cambian ante nuevas perturbaciones“.

Parse y Nomic siguen incorporando nuevos socios. Para consultas sobre licencias, visite www.parsebiosciences.com/cascade.

Acerca de Nomic Bio

Nomic fue fundada con el objetivo de facilitar la medición de la biología y permitir que los científicos prolonguen la vida humana, haciendo que la proteómica sea accesible, escalable y rutinaria. Gracias a su tecnología patentada nELISA®, Nomic proporciona datos proteicos cuantitativos, a gran escala y rentables, con el fin de acelerar los procesos de descubrimiento, desarrollo y traslación. Su servicio integral combina contenido flexible, asesoramiento de expertos y resultados listos para el análisis, lo que permite una integración fluida de la proteómica en todas las etapas del desarrollo de fármacos y biomarcadores. La misión de Nomic es lograr que la proteómica sea un elemento omnipresente en la biología moderna. Para obtener más información, visite nomic.bio o síganos en LinkedIn.

Acerca de Parse Biosciences

Parse Biosciences, una empresa de QIAGEN, es una compañía global de ciencias de la vida cuya misión es acelerar los avances en la salud humana y la investigación científica. Su enfoque pionero permite a los investigadores realizar secuenciación unicelular a una escala sin precedentes y con una facilidad inédita, lo que ha impulsado descubrimientos revolucionarios en áreas como el tratamiento del cáncer, la reparación de tejidos, las terapias con células madre y la investigación de enfermedades renales y hepáticas, así como del desarrollo cerebral y del sistema inmunitario.

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