Arima Genomics完成客戶驗證並推出Arima-HiChIP試劑盒和服務

聖地牙哥--()--(美國商業資訊)--Arima Genomics, Inc.是專注於促進基因體結構資訊在醫學研究、診斷和治療中應用的生物科技公司,該公司今天宣佈,植基於現有Arima-HiC平臺的HiChIP應用已全面上市。隨著此次上市,研究人員現在能從單次實驗獲得在感興趣的蛋白佔據的基因體位點上特別豐富的長距離染色質相互作用,從而能加快發現和發表速度並降低成本。

此次上市代表已完成成功的市場開發和Beta測試計畫,由此衍生出市場需求的進一步證據、強化品質管制提升產品性能,並提供來自客戶驗證的寶貴回饋意見。Mayo Clinic生理學教授Tamas Ordog表示:「我們對經由Arima HiChIP方案獲得的資料感到非常滿意。」關鍵意見領袖、Case Western大學教授、Case綜合癌症中心成員Peter Scacheri表示:「結果顯示出很高的可重複性和出色的整體品質,該試劑盒節省了時間和定序成本。我們特別重視直截了當的品質管制步驟和易用性,整體而言,Arima HiChIP具有重大價值。我們對Arima-HiChIP資料的資訊性質和品質感到滿意。」

HiChIP資料能為基因調控的機制基礎及其如何最終導致疾病狀態提供資訊。Sanford Burnham Prebys長老會醫學發現研究所發育、老化和再生計畫教授Lorenzo Puri表示:「透過H3K27ac或H3K4me4 HiChIP豐富的活躍染色質功能,我們發現了高解析度的染色質環化事件,這些事件在健康狀態、老化或肌肉營養不良等疾病的肌肉再生過程中,可促進肌肉幹細胞從靜止狀態過渡到致力於分化成再生肌纖維的過程中的基因控制。」

認識到HiChIP的價值且在缺乏經商業驗證之試劑盒的情況下,科學界一直在自製這種生物化學。研究神經精神病學遺傳學的加州大學舊金山分校助理教授Yin Shen表示:「我們一直在自製HiChIP,因為它可提供以往分別進行HiC和ChIP-Seq實驗所獲得的關鍵見解。在最具挑戰性的終末分化神經元樣本中,我們的自製版本之前失敗了,即便使用此類樣本,Arima-HiChIP仍可生成卓越的資料品質和可重複性,因此為我們節省了可觀的重複成本。」

早期客戶產生的回饋意見和資料也有助於瞭解HiChIP在相關分析(例如HiC和ChIP-Seq)背景中的定位。特別是,儘管HiC可反映基因體組織的全域架構,但HiChIP可豐富源自於研究感興趣的特定基因體位元點的目標染色質相互作用。根據研究的要求,研究人員能充分利用全方位HiC、更高解析度的HiChIP或兩者。Puri補充道:「HiChIP資料與我們全基因體HiC資料的綜合分析,對於理解影響基因調控之更廣泛的區室化和拓撲架構以及特定順式調控元件之間更精細的解析度聯繫至關重要。」

重要的是,由於來自HiChIP的染色質相互作用資料以三維方式反映基因體的固有折疊(和錯誤折疊),因此這也可以為重新排列的癌症染色體上的基因調節錯誤提供資訊,這是傳統ChIP-Seq實驗所缺少的重要見解。Scacheri補充道: 「我們不僅觀察到跨癌症基因體的染色體內順式調控相互作用,而且還觀察到重排染色體上染色體間的異位順式調控相互作用。我們認為,該資料將有助於加強勾勒癌症中基因與表觀基因驅動子事件之間的關係。」

為了回應客戶對資料分析的需求,該公司與學術夥伴合作,以促使經學界驗證的開源生物資訊學工具最佳化,例如MAPS。Arima MAPS產品線可自動輸出易於理解的品質管制統計資料,並在使用者按下按鈕後繼續生成染色質相互作用熱圖和弧形圖,以便在基因體瀏覽器中輕鬆查看。除了簡化的資料分析之外,該公司還專注於加強客戶服務和支援體驗,這是其為加快樣本至發現和發表工作而不斷努力的一部分。Ordog補充道:「Arima技術支援團隊非常出色。」

該公司在其現有Arima-HiC平臺上開發HiChIP,從一個通用Arima試劑盒同時支援HiC和HiChIP。此外,該公司已擴大業務規模,並強化商業團隊,以便在全球發售這些試劑盒。Arima Genomics商業總監Joseph Spidle表示:「經客戶驗證的Arima-HiChIP試劑盒和服務的上市代表重要的里程碑,因為它既可以達成目標HiC方法的商業化,又是對傳統ChIP-Seq的升級。我們的目標是在促使基因體結構見解可用性大眾化的同時,為Arima-HiC平臺添加有臨床意義和科學意義的應用,以促進基礎研究和疾病相關研究。」

關於Arima Genomics

Arima Genomics, Inc.是一家生物科技公司,其目標是促進對基因體定序和結構及其在健康、疾病、物種演化中角色的瞭解。欲瞭解進一步資訊,請造訪:http://www.arimagenomics.com

免責聲明:本公告之原文版本乃官方授權版本。譯文僅供方便瞭解之用,煩請參照原文,原文版本乃唯一具法律效力之版本。

Contacts

Siddarth Selvaraj
執行長,Arima Genomics
sid@arimagenomics.com

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