Fluidigm und das „Ludwig Institute for Cancer Research“ tun sich zu Messung der Expression von 900 Genen in 96 Proben in einer Woche zusammen

SOUTH SAN FRANCISCO, Kalifornien--(BUSINESS WIRE)--Fluidigm hat heute bekannt gegeben, dass die Zweigstelle Sãn Paulo des internationalen Ludwig Institute for Cancer Research (LICR) das BioMark™-System des Unternehmens verwendet hat, um in Rekordzeit für das Institut eine groß angelegte Analyse durchzuführen, die das ganze menschliche „Genom der Zelloberflächenproteine“ (der Genomsatz, der die Proteine der Zelloberfläche verschlüsselt) beschreibt. Das Experiment komprimierte Monate Arbeit für das LICR-Team in nur eine Woche in Fluidigms Labor in South San Francisco.

„Ich bin für eine Woche mit dem Ziel zu Fluidigm gekommen, die Expression von 900 Genen in 96 Proben zu analysieren. Zuerst dachte ich, die Aufgabe sei unmöglich … aber es stellte sich heraus, dass es durch die Verwendung von integrierten Strömungskreisläufen erreichbar war. Wow!“, so Julia Pinheiro Chagas da Cunha, PhD., von der LICR-Zweigstelle in Sãn Paulo, Brasilien. „Fluidigms dynamische Anordnungen sind wirklich beeindruckend. Mit weniger als 100 Mikrogramm RNA und in wenigen Stunden konnten wir gute Daten bekommen, was es möglich machte, die Genexpression in kleinen Mengen Gewebe zu analysieren, wie Biopsien.“

Das LICR-Team verwendete Tumornadelbiopsien von Dickdarm-, Lungen-, Prostata- und Brustproben (auch als Kontrollproben), um seine Experimente durchzuführen. Unter Verwendung von Fluidigms neuen dynamischen 96.96 Anordnungen war Dr. da Cunha in der Lage, 55000 Datenpunkte an einem Tag mit nur vier Stunden „praktischer Arbeit“ im Labor zu bearbeiten.

Gajus Worthington, Präsident und CEO von Fluidigm, bemerkte, dass die Arbeit des Ludwig Institute of Cancer Research gegenwärtig die dynamischen 48.48 Anordnungen des Unternehmens verwendet. „Aber mit unseren neu eingeführten dynamischen 96.96 Anordnungen kann all diese Arbeit an Genexpressionen jetzt schneller durchgeführt werden, oder viermal so viele Proben können in der gleichen Woche bei sogar niedrigeren Kosten abgeschlossen werden.“

Mit der Verfügbarkeit der Humangenomsequenz und einer großen Datenmenge von exprimierten Genen bei Krebs führt das LICR mehrere Studien durch, mit denen sie versuchen, Gene zu charakterisieren, die bei Krebs differenziert exprimiert werden. Sandro J. de Souza, Ph.D., vom Ludwig Institute sagte: „Wir haben eine groß angelegte Analyse mit dem Ziel der Charakterisierung des gesamten menschlichen „Genoms der Zelloberflächenproteine“ durchgeführt, haben die Genexpressionsdaten in eine Wissensdatenbank für das „Genom der Zelloberflächenproteine“ integriert, Genkandidaten identifiziert, die in Gliobastomen und Dickdarmtumoren differenziert exprimiert werden, und wollen einige dieser Kandidaten unter Verwendung einer groß angelegten qPCR-Strategie verproben. Fluidigms dynamische 96.96 Anordnungen werden eine entscheidende Rolle in der qPCR-Phase unserer Forschung spielen.“

Fluidigms neue BioMark™ Dynamische 96.96 Anordnung ist in der Lage, 9.216 gleichzeitige PCR-Experimente in Echtzeit durchzuführen, indem sie Gold-Standard TaqMan®-Proben in Nanolitermengen laufen lässt. Diese neue Generation integrierter Strömungskreisläufe ermöglicht es Biowissenschaftlern, neue Stufen der Kosten- und Logistikeffizienz und Flexibilität zu erreichen und auch ein gesteigertes Profilabrichtungsniveau aus winzigen Probemengen.

Wenn man Fluidigms neue Dynamische 96.96 Anordnungen mit den branchenüblichen 384-Titersystemen unter Verwendung von 10 uL Reaktionsvolumina vergleicht, bietet die 96.96 entscheidende Verbesserungen in Produktivität und Effizienz.

• 24-fach höherer Durchsatz: eine Dynamische 96.96 Anordnung ergibt 9.216 parallele Datenpunkte, das entspricht vierundzwanzig 384-Mikrotiterplatten.
• 192-fach weniger Mastermischung: 240 Mikroliter verglichen mit 46.080 Mikrolitern für 9.216 Reaktionen.
• Eine 96-fache Verminderung der Aufbaukomplexität: die 96.96 Dynamische Anordnung erfordert nur 192 Pipettierungsschritte für 9.216 Reaktionen, verglichen mit 18.432 Pipettierungsschritten für eine entsprechende Anzahl von Mikrotiterplatten-Experimenten.

Über Fluidigm

Fluidigm entwickelt, produziert und vermarktet die urheberrechtlich geschützten Integrierten Strömungskreislaufsysteme (Integrated Fluidic Circuit, IFC), die die Produktivität in der Biowissenschaftsforschung entscheidend erhöhen. Fluidigms IFCs ermöglichen die gleichzeitige Durchführung von Tausenden von hoch entwickelten biochemischen Messungen in extrem winzigen Mengen. Diese „integrierten Kreisläufe für Biologie“ werden durch die Miniaturisierung und Integrierung flüssiger Leitungsbestandteile in einem einzigen mikrobearbeiteten Gerät ermöglicht. Fluidigms IFC-Systeme, die aus Geräteausstattung, Software und Einmal-IFCs bestehen, erhöhen verglichen mit konventionellen Laborsystemen den Durchsatz, senken die Kosten und verbessern die Sensibilität. Die Produkte von Fluidigm wurden nicht von der Food and Drug Administration zur Verwendung als Diagnostikgeräte freigegeben oder zugelassen und sind nur für Forschungszwecke erhältlich.

Für mehr Informationen besuchen Sie bitte www.Fluidigm.com.

Fluidigm, das Fluidigm-Logo, Topaz, BioMark und NanoFlex sind Warenzeichen der Fluidigm Corporation.

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